Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

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Length 1,202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
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BC034090A0A087WP46 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC034090A0A087WP46 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
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BC034090A0A087WP46 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BC034090A0A087WP46 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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BC034090A0A087WP46 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BC034090A0A087WP46 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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BC034090A0A087WP46 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC034090A0A087WP46 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC034090A0A087WP46 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC034090A0A087WP46 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BC034090A0A087WP46 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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BC034090A0A087WP46 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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BC034090A0A087WP46 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BC034090A0A087WP46 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC034090A0A087WP46 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC034090A0A087WP46 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BC034090A0A087WP46 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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BC034090A0A087WP46 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BC034090A0A087WP46 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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BC034090A0A087WP46 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BC034090A0A087WP46 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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BC034090A0A087WP46 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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BC034090A0A087WP46 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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BC034090A0A087WP46 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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BC034090A0A087WP46 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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BC034090A0A087WP46 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BC034090A0A087WP46 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BC034090A0A087WP46 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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