Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms