Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx7F8VPJ6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms