Protein–RNA interactions for Protein: V9GYS6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYS6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
V9GYS6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
V9GYS6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
V9GYS6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
V9GYS6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
V9GYS6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
V9GYS6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
V9GYS6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
V9GYS6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
V9GYS6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
V9GYS6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
V9GYS6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
V9GYS6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
V9GYS6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
V9GYS6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
V9GYS6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
V9GYS6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
V9GYS6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
V9GYS6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYS6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYS6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYS6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYS6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYS6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
V9GYS6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
V9GYS6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
V9GYS6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYS6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.3■■□□□ 1
V9GYS6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYS6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
V9GYS6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYS6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYS6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYS6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYS6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYS6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYS6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYS6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYS6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYS6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYS6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYS6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYS6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYS6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.28■■□□□ 1
V9GYS6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYS6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYS6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYS6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYS6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYS6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYS6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYS6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYS6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
V9GYS6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYS6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYS6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYS6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYS6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYS6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYS6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYS6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYS6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYS6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYS6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYS6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYS6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYS6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYS6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYS6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYS6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYS6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYS6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYS6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYS6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYS6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYS6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYS6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYS6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYS6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYS6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
V9GYS6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
V9GYS6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
V9GYS6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
V9GYS6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
V9GYS6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
V9GYS6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
V9GYS6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
V9GYS6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
V9GYS6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
V9GYS6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
V9GYS6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
V9GYS6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
V9GYS6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
V9GYS6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
V9GYS6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
V9GYS6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
V9GYS6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
V9GYS6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
V9GYS6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
V9GYS6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.6 ms