Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GYQ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
V9GYQ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GYQ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
V9GYQ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GYQ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GYQ6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GYQ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GYQ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GYQ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GYQ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GYQ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
V9GYQ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GYQ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GYQ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
V9GYQ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GYQ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GYQ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GYQ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GYQ6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GYQ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GYQ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
V9GYQ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
V9GYQ6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
V9GYQ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
V9GYQ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
V9GYQ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
V9GYQ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
V9GYQ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
V9GYQ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
V9GYQ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
V9GYQ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
V9GYQ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
V9GYQ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
V9GYQ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
V9GYQ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
V9GYQ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
V9GYQ6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
V9GYQ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
V9GYQ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
V9GYQ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
V9GYQ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
V9GYQ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
V9GYQ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
V9GYQ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
V9GYQ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
V9GYQ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
V9GYQ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
V9GYQ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
V9GYQ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
V9GYQ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
V9GYQ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
V9GYQ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
V9GYQ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
V9GYQ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
V9GYQ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
V9GYQ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
V9GYQ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
V9GYQ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
V9GYQ6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
V9GYQ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
V9GYQ6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
V9GYQ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
V9GYQ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
V9GYQ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
V9GYQ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
V9GYQ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
V9GYQ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
V9GYQ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
V9GYQ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
V9GYQ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
V9GYQ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
V9GYQ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
V9GYQ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
V9GYQ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
V9GYQ6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
V9GYQ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
V9GYQ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
V9GYQ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
V9GYQ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
V9GYQ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
V9GYQ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
V9GYQ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
V9GYQ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
V9GYQ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
V9GYQ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
V9GYQ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
V9GYQ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
V9GYQ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
V9GYQ6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
V9GYQ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
V9GYQ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
V9GYQ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
V9GYQ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
V9GYQ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
V9GYQ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
V9GYQ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
V9GYQ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
V9GYQ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
V9GYQ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms