Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms