Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U3KQV3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQV3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQV3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQV3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQV3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U3KQV3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U3KQV3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U3KQV3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U3KQV3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U3KQV3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
U3KQV3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U3KQV3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U3KQV3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U3KQV3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U3KQV3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U3KQV3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U3KQV3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U3KQV3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U3KQV3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U3KQV3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQV3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQV3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQV3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U3KQV3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U3KQV3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U3KQV3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U3KQV3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U3KQV3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U3KQV3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U3KQV3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
U3KQV3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U3KQV3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U3KQV3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U3KQV3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U3KQV3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U3KQV3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U3KQV3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U3KQV3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
U3KQV3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U3KQV3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U3KQV3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U3KQV3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U3KQV3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U3KQV3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U3KQV3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U3KQV3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
U3KQV3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U3KQV3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U3KQV3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
U3KQV3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
U3KQV3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U3KQV3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U3KQV3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U3KQV3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQV3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQV3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U3KQV3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQV3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQV3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQV3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQV3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQV3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQV3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQV3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQV3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U3KQV3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
U3KQV3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U3KQV3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U3KQV3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U3KQV3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U3KQV3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U3KQV3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U3KQV3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
U3KQV3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U3KQV3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQV3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQV3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQV3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U3KQV3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQV3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQV3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQV3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQV3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQV3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQV3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
U3KQV3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U3KQV3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U3KQV3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U3KQV3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
U3KQV3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U3KQV3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U3KQV3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U3KQV3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQV3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQV3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQV3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQV3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQV3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U3KQV3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms