Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W5

Rbm6, RNA-binding motif protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm6S4R1W5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbm6S4R1W5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbm6S4R1W5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm6S4R1W5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm6S4R1W5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm6S4R1W5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm6S4R1W5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm6S4R1W5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rbm6S4R1W5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rbm6S4R1W5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rbm6S4R1W5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rbm6S4R1W5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbm6S4R1W5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbm6S4R1W5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbm6S4R1W5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rbm6S4R1W5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rbm6S4R1W5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rbm6S4R1W5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbm6S4R1W5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm6S4R1W5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm6S4R1W5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm6S4R1W5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm6S4R1W5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm6S4R1W5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm6S4R1W5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rbm6S4R1W5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm6S4R1W5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rbm6S4R1W5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rbm6S4R1W5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms