Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y8

Plpbp, Pyridoxal phosphate homeostasis protein, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlpbpQ9Z2Y8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PlpbpQ9Z2Y8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PlpbpQ9Z2Y8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PlpbpQ9Z2Y8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PlpbpQ9Z2Y8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PlpbpQ9Z2Y8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PlpbpQ9Z2Y8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PlpbpQ9Z2Y8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PlpbpQ9Z2Y8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PlpbpQ9Z2Y8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PlpbpQ9Z2Y8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PlpbpQ9Z2Y8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms