Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mbd3Q9Z2D8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mbd3Q9Z2D8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Mbd3Q9Z2D8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Mbd3Q9Z2D8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mbd3Q9Z2D8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms