Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
VarsQ9Z1Q9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VarsQ9Z1Q9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VarsQ9Z1Q9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VarsQ9Z1Q9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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