Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfkbiaQ9Z1E3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfkbiaQ9Z1E3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.3 ms