Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z175

Loxl3, Lysyl oxidase homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl3Q9Z175 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Loxl3Q9Z175 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Loxl3Q9Z175 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Loxl3Q9Z175 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Loxl3Q9Z175 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Loxl3Q9Z175 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Loxl3Q9Z175 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Loxl3Q9Z175 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Loxl3Q9Z175 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Loxl3Q9Z175 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Loxl3Q9Z175 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Loxl3Q9Z175 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Loxl3Q9Z175 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Loxl3Q9Z175 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Loxl3Q9Z175 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Loxl3Q9Z175 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Loxl3Q9Z175 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms