Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr1h3Q9Z0Y9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr1h3Q9Z0Y9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr1h3Q9Z0Y9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr1h3Q9Z0Y9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms