Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AireQ9Z0E3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
AireQ9Z0E3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AireQ9Z0E3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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