Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CCDC61Q9Y6R9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC61Q9Y6R9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC61Q9Y6R9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC61Q9Y6R9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC61Q9Y6R9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms