Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
MAP3K4Q9Y6R4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
MAP3K4Q9Y6R4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
MAP3K4Q9Y6R4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
MAP3K4Q9Y6R4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
MAP3K4Q9Y6R4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC38.89■■■■□ 3.82
MAP3K4Q9Y6R4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
MAP3K4Q9Y6R4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
MAP3K4Q9Y6R4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
MAP3K4Q9Y6R4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
MAP3K4Q9Y6R4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
MAP3K4Q9Y6R4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC38.87■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
MAP3K4Q9Y6R4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
MAP3K4Q9Y6R4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
MAP3K4Q9Y6R4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
MAP3K4Q9Y6R4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
MAP3K4Q9Y6R4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
MAP3K4Q9Y6R4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
MAP3K4Q9Y6R4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
MAP3K4Q9Y6R4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
MAP3K4Q9Y6R4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
MAP3K4Q9Y6R4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
MAP3K4Q9Y6R4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
MAP3K4Q9Y6R4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
MAP3K4Q9Y6R4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
MAP3K4Q9Y6R4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
MAP3K4Q9Y6R4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
MAP3K4Q9Y6R4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms