Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
LAMC3Q9Y6N6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
LAMC3Q9Y6N6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC43.96■■■■■ 4.63
LAMC3Q9Y6N6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC43.96■■■■■ 4.63
LAMC3Q9Y6N6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
LAMC3Q9Y6N6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC43.89■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
LAMC3Q9Y6N6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC43.88■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC43.87■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
LAMC3Q9Y6N6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
LAMC3Q9Y6N6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
LAMC3Q9Y6N6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
LAMC3Q9Y6N6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
LAMC3Q9Y6N6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
LAMC3Q9Y6N6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
LAMC3Q9Y6N6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
LAMC3Q9Y6N6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
LAMC3Q9Y6N6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
LAMC3Q9Y6N6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
LAMC3Q9Y6N6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
LAMC3Q9Y6N6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
LAMC3Q9Y6N6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC43.71■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
LAMC3Q9Y6N6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
LAMC3Q9Y6N6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
LAMC3Q9Y6N6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
LAMC3Q9Y6N6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
LAMC3Q9Y6N6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
LAMC3Q9Y6N6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
LAMC3Q9Y6N6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
LAMC3Q9Y6N6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
LAMC3Q9Y6N6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
LAMC3Q9Y6N6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
LAMC3Q9Y6N6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.58
LAMC3Q9Y6N6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
LAMC3Q9Y6N6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
LAMC3Q9Y6N6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
LAMC3Q9Y6N6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
LAMC3Q9Y6N6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
LAMC3Q9Y6N6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
LAMC3Q9Y6N6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
LAMC3Q9Y6N6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
LAMC3Q9Y6N6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC43.56■■■■■ 4.56
LAMC3Q9Y6N6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
LAMC3Q9Y6N6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
LAMC3Q9Y6N6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
LAMC3Q9Y6N6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
LAMC3Q9Y6N6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
LAMC3Q9Y6N6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
LAMC3Q9Y6N6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
LAMC3Q9Y6N6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms