Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPG1Q9Y678 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPG1Q9Y678 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPG1Q9Y678 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms