Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
THRAP3Q9Y2W1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
THRAP3Q9Y2W1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
THRAP3Q9Y2W1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
THRAP3Q9Y2W1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
THRAP3Q9Y2W1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
THRAP3Q9Y2W1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
THRAP3Q9Y2W1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
THRAP3Q9Y2W1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
THRAP3Q9Y2W1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
THRAP3Q9Y2W1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
THRAP3Q9Y2W1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
THRAP3Q9Y2W1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
THRAP3Q9Y2W1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
THRAP3Q9Y2W1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
THRAP3Q9Y2W1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
THRAP3Q9Y2W1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
THRAP3Q9Y2W1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
THRAP3Q9Y2W1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
THRAP3Q9Y2W1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms