Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC3AQ9Y2H6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC3AQ9Y2H6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC3AQ9Y2H6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC3AQ9Y2H6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms