Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NUDCQ9Y266 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NUDCQ9Y266 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
NUDCQ9Y266 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUDCQ9Y266 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NUDCQ9Y266 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NUDCQ9Y266 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NUDCQ9Y266 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NUDCQ9Y266 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NUDCQ9Y266 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUDCQ9Y266 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUDCQ9Y266 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUDCQ9Y266 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NUDCQ9Y266 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
NUDCQ9Y266 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms