Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HIGD1AQ9Y241 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HIGD1AQ9Y241 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HIGD1AQ9Y241 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.1 ms