Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC2Q9Y235 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
APOBEC2Q9Y235 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOBEC2Q9Y235 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC2Q9Y235 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms