Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CEP164Q9UPV0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CEP164Q9UPV0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CEP164Q9UPV0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
CEP164Q9UPV0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
CEP164Q9UPV0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
CEP164Q9UPV0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.53
CEP164Q9UPV0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
CEP164Q9UPV0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CEP164Q9UPV0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CEP164Q9UPV0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
CEP164Q9UPV0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC43.35■■■■■ 4.53
CEP164Q9UPV0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CEP164Q9UPV0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
CEP164Q9UPV0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
CEP164Q9UPV0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CEP164Q9UPV0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CEP164Q9UPV0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CEP164Q9UPV0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC43.26■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
CEP164Q9UPV0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
CEP164Q9UPV0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
CEP164Q9UPV0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
CEP164Q9UPV0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CEP164Q9UPV0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CEP164Q9UPV0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CEP164Q9UPV0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CEP164Q9UPV0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CEP164Q9UPV0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
CEP164Q9UPV0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
CEP164Q9UPV0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CEP164Q9UPV0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CEP164Q9UPV0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CEP164Q9UPV0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CEP164Q9UPV0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CEP164Q9UPV0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CEP164Q9UPV0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CEP164Q9UPV0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CEP164Q9UPV0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
CEP164Q9UPV0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CEP164Q9UPV0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CEP164Q9UPV0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
CEP164Q9UPV0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
CEP164Q9UPV0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CEP164Q9UPV0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CEP164Q9UPV0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms