Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMD4AQ9UPU9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SAMD4AQ9UPU9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD4AQ9UPU9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD4AQ9UPU9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms