Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AP4E1Q9UPM8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AP4E1Q9UPM8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP4E1Q9UPM8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP4E1Q9UPM8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP4E1Q9UPM8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP4E1Q9UPM8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AP4E1Q9UPM8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP4E1Q9UPM8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP4E1Q9UPM8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP4E1Q9UPM8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP4E1Q9UPM8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP4E1Q9UPM8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP4E1Q9UPM8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP4E1Q9UPM8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP4E1Q9UPM8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms