Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TTF2Q9UNY4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TTF2Q9UNY4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TTF2Q9UNY4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TTF2Q9UNY4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms