Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPS3Q9UNS2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COPS3Q9UNS2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS3Q9UNS2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS3Q9UNS2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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