Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFSF18Q9UNG2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNFSF18Q9UNG2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF18Q9UNG2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.9 ms