Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PALD1Q9ULE6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PALD1Q9ULE6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PALD1Q9ULE6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PALD1Q9ULE6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PALD1Q9ULE6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PALD1Q9ULE6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PALD1Q9ULE6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms