Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNH3Q9ULD8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNH3Q9ULD8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNH3Q9ULD8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNH3Q9ULD8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNH3Q9ULD8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNH3Q9ULD8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KCNH3Q9ULD8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNH3Q9ULD8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNH3Q9ULD8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms