Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF346Q9UL40 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF346Q9UL40 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF346Q9UL40 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms