Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VAV3Q9UKW4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
VAV3Q9UKW4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
VAV3Q9UKW4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VAV3Q9UKW4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VAV3Q9UKW4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VAV3Q9UKW4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VAV3Q9UKW4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms