Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERG28Q9UKR5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERG28Q9UKR5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERG28Q9UKR5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms