Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
PARP4Q9UKK3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PARP4Q9UKK3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PARP4Q9UKK3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PARP4Q9UKK3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PARP4Q9UKK3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms