Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APPL1Q9UKG1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APPL1Q9UKG1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APPL1Q9UKG1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms