Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD3Q9UJU5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD3Q9UJU5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD3Q9UJU5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms