Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSR3Q9UJK0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSR3Q9UJK0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSR3Q9UJK0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSR3Q9UJK0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSR3Q9UJK0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms