Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RABGEF1Q9UJ41 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RABGEF1Q9UJ41 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RABGEF1Q9UJ41 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABGEF1Q9UJ41 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms