Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT172Q9UG01 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
IFT172Q9UG01 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
IFT172Q9UG01 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
IFT172Q9UG01 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
IFT172Q9UG01 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
IFT172Q9UG01 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
IFT172Q9UG01 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT172Q9UG01 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
IFT172Q9UG01 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
IFT172Q9UG01 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
IFT172Q9UG01 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
IFT172Q9UG01 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
IFT172Q9UG01 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
IFT172Q9UG01 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
IFT172Q9UG01 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
IFT172Q9UG01 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
IFT172Q9UG01 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
IFT172Q9UG01 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms