Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XCL2Q9UBD3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
XCL2Q9UBD3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
XCL2Q9UBD3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms