Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFIP11Q9UBB9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFIP11Q9UBB9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFIP11Q9UBB9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFIP11Q9UBB9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFIP11Q9UBB9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFIP11Q9UBB9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFIP11Q9UBB9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFIP11Q9UBB9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFIP11Q9UBB9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFIP11Q9UBB9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms