Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C6orf48Q9UBA6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C6orf48Q9UBA6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C6orf48Q9UBA6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms