Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sept6Q9R1T4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sept6Q9R1T4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept6Q9R1T4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sept6Q9R1T4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept6Q9R1T4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept6Q9R1T4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept6Q9R1T4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sept6Q9R1T4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept6Q9R1T4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept6Q9R1T4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept6Q9R1T4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept6Q9R1T4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept6Q9R1T4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept6Q9R1T4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sept6Q9R1T4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms