Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp6ap1Q9R1Q9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Atp6ap1Q9R1Q9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Atp6ap1Q9R1Q9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6ap1Q9R1Q9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6ap1Q9R1Q9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6ap1Q9R1Q9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Atp6ap1Q9R1Q9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Atp6ap1Q9R1Q9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Atp6ap1Q9R1Q9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Atp6ap1Q9R1Q9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6ap1Q9R1Q9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6ap1Q9R1Q9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Atp6ap1Q9R1Q9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Atp6ap1Q9R1Q9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Atp6ap1Q9R1Q9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Atp6ap1Q9R1Q9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Atp6ap1Q9R1Q9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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