Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfrsf10bQ9QZM4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.1 ms