Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Limd1Q9QXD8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Limd1Q9QXD8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Limd1Q9QXD8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Limd1Q9QXD8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Limd1Q9QXD8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Limd1Q9QXD8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Limd1Q9QXD8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Limd1Q9QXD8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Limd1Q9QXD8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Limd1Q9QXD8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Limd1Q9QXD8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Limd1Q9QXD8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Limd1Q9QXD8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Limd1Q9QXD8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Limd1Q9QXD8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Limd1Q9QXD8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms