Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PdcQ9QW08 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PdcQ9QW08 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PdcQ9QW08 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PdcQ9QW08 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms