Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rai2Q9QVY8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rai2Q9QVY8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rai2Q9QVY8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rai2Q9QVY8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms